Função Viral 

        Depois de construida a tabela com informação sobre os vários genes e respetivas proteínas selecionou-se 3 com função viral (mais especificamente 'Viral functions / Phage / Transposases') e através do ncbi cdd verificou-se os dominios conservados. Os genes selecionados foram lpg2173, lpg2184 ('hypotetical protein') e lpg2363.

 

       Como resultado obteve-se o seguinte quadro:

        De forma a visualizar melhor os resultados visualizou-se para cada uma das proteinas e foi possivel observar que para o lpg 2173 e lpg2363 os dominios conservados são os mesmos:

    Já para a lpg2184 apenas foi encontrado um dominio conservado:

   

        Foi possivel observar que todos os dominios conservados estão relacionados com transposase, algo que já era mencionado na função das proteinas. A transposase é uma enzima que tem como função catalizar o movimento do transposão (elemento genético que se move ao longo do genoma). Este processor é de enorme importância pois está envolvido na recombinação genética (do tipo não homóloga - não requer semelhança entre as cadeias de DNA) e pode estar relacionado com vários processos como gerar novas combinações de genes (ex:meiose), integrar elementos de DNA especifios (por exemplo nos virus) ou reparar DNA. A inserção de transposões noutros locais do genoma pode interferir com a expressão dos genes e pode levar a mutações que levam à resistência aos medicamentos.